Superkomputer AS dengan 200.000 triliun gerakan per detik menunjukkan bagaimana DNA memperbaiki dirinya sendiri.
Courtesy of InterestingEngineering

Superkomputer AS dengan 200.000 triliun gerakan per detik menunjukkan bagaimana DNA memperbaiki dirinya sendiri.

14 Mar 2025, 20.38 WIB
97 dibaca
Share
Ikhtisar 15 Detik
  • Penelitian ini memberikan wawasan baru tentang mekanisme perbaikan DNA dan dampak mutasi genetik.
  • Simulasi molekuler menggunakan superkomputer sangat penting untuk memahami dinamika kompleks biologis.
  • Peningkatan pemahaman tentang jalur NER dapat membantu dalam pengembangan pengobatan untuk penyakit genetik dan kanker.
Para ilmuwan dari Universitas Georgia State menggunakan superkomputer Summit untuk mempelajari jalur perbaikan DNA yang rumit yang disebut perbaikan eksisi nukleotida (NER). NER membantu memperbaiki kerusakan pada DNA melalui tiga tahap: pengenalan, verifikasi, dan perbaikan. Salah satu komponen penting dalam proses ini adalah kompleks pra-insisi (PInC), yang dapat berubah bentuk untuk melakukan fungsi perbaikan yang berbeda. Penelitian ini bertujuan untuk memahami bagaimana tubuh memperbaiki DNA dan dapat membantu dalam pengembangan pengobatan untuk penyakit genetik dan kanker.
Tim peneliti menggunakan simulasi dengan perangkat lunak NAMD untuk menganalisis bagaimana komponen PInC bergerak dan berinteraksi. Mereka menemukan bahwa mutasi genetik yang mengganggu fungsi NER dapat menyebabkan penyakit serius, seperti xeroderma pigmentosum, yang meningkatkan risiko kanker kulit, dan sindrom Cockayne, yang mempengaruhi pertumbuhan dan perkembangan. Penelitian ini memberikan wawasan penting tentang bagaimana penyakit ini muncul dan bagaimana perbaikan DNA dapat dilakukan dengan lebih efektif di masa depan.

Pertanyaan Terkait

Q
Apa itu nucleotide excision repair (NER)?
A
Nucleotide excision repair (NER) adalah jalur perbaikan DNA yang memperbaiki berbagai jenis kerusakan DNA melalui proses yang terstruktur.
Q
Apa peran kompleks pre-incision (PInC) dalam jalur NER?
A
Kompleks pre-incision (PInC) berperan penting dalam mengatur proses perbaikan DNA pada tahap akhir jalur NER.
Q
Mengapa mutasi dalam protein NER dapat menyebabkan penyakit genetik?
A
Mutasi dalam protein NER dapat mengganggu fungsi perbaikan DNA, yang dapat menyebabkan kondisi seperti xeroderma pigmentosum dan Cockayne syndrome.
Q
Apa yang dilakukan superkomputer Summit dalam penelitian ini?
A
Superkomputer Summit digunakan untuk menjalankan simulasi molekuler yang mendalam untuk memahami dinamika kompleks PInC.
Q
Apa rencana penelitian selanjutnya setelah penggunaan Summit?
A
Rencana penelitian selanjutnya adalah menggunakan superkomputer Frontier untuk mempelajari perbaikan DNA yang terkait dengan gen yang sedang ditranskripsi.

Artikel Serupa

Penggemar Puisi yang Mengajarkan LLM untuk Membaca dan Menulis DNAQuantaMagazine
Sains
4 bulan lalu
71 dibaca

Penggemar Puisi yang Mengajarkan LLM untuk Membaca dan Menulis DNA

Startup pengujian genetik yang kontroversial, Nucleus Genomics, mengumpulkan dana sebesar Rp 230.23 miliar ($14 juta)  dalam putaran pendanaan Seri A.TechCrunch
Sains
4 bulan lalu
74 dibaca

Startup pengujian genetik yang kontroversial, Nucleus Genomics, mengumpulkan dana sebesar Rp 230.23 miliar ($14 juta) dalam putaran pendanaan Seri A.

Ilmuwan AS menemukan cara untuk mencegah kerusakan akibat elektron liar di reaktor fusi.InterestingEngineering
Sains
5 bulan lalu
68 dibaca

Ilmuwan AS menemukan cara untuk mencegah kerusakan akibat elektron liar di reaktor fusi.

Superkomputer Summit mendukung penelitian terhadap gen 635.000 veteran Angkatan Bersenjata AS untuk mengidentifikasi hubungan dengan penyakit.InterestingEngineering
Sains
5 bulan lalu
120 dibaca

Superkomputer Summit mendukung penelitian terhadap gen 635.000 veteran Angkatan Bersenjata AS untuk mengidentifikasi hubungan dengan penyakit.

DNA origami membangun nano-dinosaurus, robot menari 1000x lebih tipis daripada rambut manusia.InterestingEngineering
Teknologi
6 bulan lalu
41 dibaca

DNA origami membangun nano-dinosaurus, robot menari 1000x lebih tipis daripada rambut manusia.

Superkomputer Frontier mencapai simulasi alam semesta eksaskala terbesar yang pernah ada.InterestingEngineering
Sains
6 bulan lalu
123 dibaca

Superkomputer Frontier mencapai simulasi alam semesta eksaskala terbesar yang pernah ada.