Artikel - SandboxAQ Rilis Dataset Raksasa untuk Mempercepat Penemuan Obat dengan AI

SandboxAQ, perusahaan AI yang muncul dari Google dan didukung NVIDIA, telah meluncurkan dataset besar bernama SAIR yang berisi lebih dari 5,2 juta struktur protein-molekul obat hasil komputasi. Dataset ini dilengkapi dengan data potensi nyata obat, sehingga dapat membantu ilmuwan memprediksi apakah molekul obat akan menempel pada protein target dengan efektif.

Interaksi antara molekul obat dan protein penting karena memengaruhi apakah obat bisa menghambat atau mengubah proses biologis, termasuk menghentikan penyebaran penyakit. Biasanya, studi eksperimental struktur ini memakan waktu dan biaya tinggi, mulai dari mendapatkan struktur 3D protein hingga menguji ribuan molekul obat.

SandboxAQ menggunakan chip NVIDIA dan model Boltz-1x untuk menghasilkan struktur komputasi sintetis yang diikatkan ke data potensi eksperimental. Setiap pasangan protein-obat dari data publik diuji dengan lima variasi pose 3D, kemudian disaring agar hasilnya akurat dan dapat diandalkan.

Walaupun AI seperti AlphaFold sudah membantu memprediksi struktur 3D, model-model ini masih kesulitan menghadapi protein dan molekul baru di luar data latih. SAIR memberikan data sintetis yang cukup besar untuk melatih model AI dengan lebih baik tanpa perlu akses ke database privat yang biasanya dimiliki perusahaan farmasi.

SandboxAQ akan menyediakan dataset SAIR secara gratis kepada para peneliti untuk mempercepat inovasi di bidang obat, sementara mereka menawarkan akses berbayar ke model AI proprietary yang dikembangkan menggunakan data ini. Langkah ini diharapkan mendekatkan prediksi ikatan obat-protein dengan akurasi laboratorium secara virtual dan lebih cepat.

Pertanyaan Terkait

Apa itu SAIR dan apa tujuannya?

SAIR adalah repositori dataset yang berisi lebih dari 5,2 juta struktur protein-obat yang dihasilkan secara komputasi dan bertujuan untuk mempermudah peneliti dalam menentukan potensi pengikatan obat.

Bagaimana cara SandboxAQ menghasilkan dataset SAIR?

SandboxAQ menghasilkan dataset SAIR dengan menggunakan chip NVIDIA untuk menghasilkan struktur sintetis berdasarkan data eksperimental yang ada.

Apa peran NVIDIA dalam pengembangan SAIR?

NVIDIA berperan dalam menyediakan teknologi dan perangkat keras yang diperlukan untuk menghasilkan struktur sintetis yang mendukung dataset SAIR.

Mengapa prediksi interaksi antara obat dan protein penting dalam penemuan obat?

Prediksi interaksi antara obat dan protein penting karena dapat menentukan apakah suatu obat dapat menghambat atau memodifikasi proses biologis, yang merupakan langkah awal dalam pengembangan kandidat obat.

Bagaimana SAIR dapat membantu peneliti dalam pelatihan model AI?

SAIR dapat membantu peneliti dengan menyediakan data yang dapat digunakan untuk melatih model AI, yang memungkinkan prediksi struktur dan potensi tanpa mengandalkan basis data pribadi.